一幅图引发的疑问：坐拥“世界最快超算”的土鳖有没有自 ...

研究团队开发了一套高精度CFD软件OpenCFD，其最高精度可达10阶。可用于包括湍流DNS在内的复杂流动高分辨率数值模拟。OpenCFD-SC具有很好的并行性能和非常强的可扩展性，可进行十万核级的超大规模并行计算。研究团队与院超算中心有着长期良好的合作。李新亮研究员是院超级计算用户委员会委员，也是院超算中心的大规模应用用户之一（曾获院超算中心“计算规模奖”），并与院超算中心陆忠华研究员等人联合承担了863“十一五”课题“面向大型飞机设计的万核级流场数值模拟软件研制”及“十二五”课题“真实飞机外型全流场和优化设计数值模拟”等。

8月16日，由中科院信息化工作领导小组办公室和计算机网络信息中心在黄山共同举办的中科院第三届超算大会上，我所分子反应动力学国家重点实验室分子模拟与设计研究组（1106组）李国辉研究员荣获首届最佳应用奖。
本次大会有来自我院天文、大气、材料、物理、化学、化工、地理、航天、生物医药等学科领域的计算科学研究人员共140余人参会，入围的研究领域项目共有18项，其中三项获得了首届最佳应用奖，另外两项最佳应用奖分别由过程所葛蔚研究员和力学所李新亮研究员获得。李国辉研究员获奖的题目是“高精度通用蛋白质大规模分子动力学模拟并行算法的实现”。在蛋白质分子动力学模拟研究领域，决定模拟结果正确与否的关键因素有两个：一个是描述原子分子之间相互作用的势函数的准确度，另外一个就是蛋白质分子构象采样的效率。李国辉研究员首次提出了结合目前最准确的蛋白质势函数及其计算方法之一——MFCC以及最好的蛋白质构象采样技术之一——REMD的高精度蛋白质模拟新方法，在目前世界最快的超级计算机、我国自行研发设计的天河二号上率先实现了针对包含106氨基酸的蛋白质采用28.5万CPU核进行分子动力学模拟，并行效率达到了32.5%，打破了原有认知中只有超大尺寸（包含几千万或更多原子数目）蛋白质才能使用超级计算机进行分子动力学模拟的传统理念，为超级计算机在生命科学、生物能源及生物医药等相关领域的应用开辟了新的研究方向。

8月16日，由中科院信息化工作领导小组办公室和计算机网络信息中心在黄山共同举办的中科院第三届超算大会上，我所分子反应动力学国家重点实验室分子模拟与设计研究组（1106组）李国辉研究员荣获首届最佳应用奖。
本次大会有来自我院天文、大气、材料、物理、化学、化工、地理、航天、生物医药等学科领域的计算科学研究人员共140余人参会，入围的研究领域项目共有18项，其中三项获得了首届最佳应用奖，另外两项最佳应用奖分别由过程所葛蔚研究员和力学所李新亮研究员获得。李国辉研究员获奖的题目是“高精度通用蛋白质大规模分子动力学模拟并行算法的实现”。在蛋白质分子动力学模拟研究领域，决定模拟结果正确与否的关键因素有两个：一个是描述原子分子之间相互作用的势函数的准确度，另外一个就是蛋白质分子构象采样的效率。李国辉研究员首次提出了结合目前最准确的蛋白质势函数及其计算方法之一——MFCC以及最好的蛋白质构象采样技术之一——REMD的高精度蛋白质模拟新方法，在目前世界最快的超级计算机、我国自行研发设计的天河二号上率先实现了针对包含106氨基酸的蛋白质采用28.5万CPU核进行分子动力学模拟，并行效率达到了32.5%，打破了原有认知中只有超大尺寸（包含几千万或更多原子数目）蛋白质才能使用超级计算机进行分子动力学模拟的传统理念，为超级计算机在生命科学、生物能源及生物医药等相关领域的应用开辟了新的研究方向。

广州超级计算中心主任袁学峰参与到柏安娜的主题演讲中，展示了高性能计算技术正如何助力社会发展和经济增长。　　他介绍，国产飞机自主研发的软件已经能够达到10万核的并行规模；高分辨大清模式数据模拟的程序已经达到了12万CPU和加1.5万MIC块的加速器；模拟小蛋白的分子动力学，30万核的并行计算测试完成；

hswz 发表于 2014-7-27 19:45
广州超级计算中心主任袁学峰参与到柏安娜的主题演讲中，展示了高性能计算技术正如何助力社会发展和经济增长 ...
多谢资料！

　　日前，全球最大规模超算大赛——2014年世界大学生超级计算机竞赛(以下简称ASC14)圆满闭幕。本次竞赛中首次设立的e Prize计算挑战奖由于要求参赛队在全球最快超级计算机天河2号上进行指定赛题3D-EW的应用优化性能扩展而备受关注。最终，上海交通大学以在天河2号上完成20万核应用性能扩展的优异成绩获得满分并得到评审专家一致好评，成功荣获该项大奖。
　　ASC大赛中首次设立e Prize计算挑战奖，旨在打造青年人才的戈登·贝尔奖(Gordon Bell Prize)，鼓励青年人才勇于解决超算应用难题敢于挑战计算性能极限，激励青年人才利用超级计算机推动科学与工程领域实现应用突破。
　　据ASC14竞赛评审委员会专家介绍，e Prize强调“挑战”，这个挑战就是提高超算应用软件的并行设计和扩展效率，从而真正发挥出超级计算机的应用价值，这实际上就是要解决目前超算发展中普遍面临的“大机器，小应用”的局面。据悉，ASC14竞赛评审委员会由来自中国、美国、新加坡、中国台湾、中国香港等国家和地区，覆盖计算数学、应用物理、材料科学、量化计算、航空航天、大气物理、石油勘探等诸多超算应用领域的顶级专家组成。
　　e Prize计算挑战奖经过两轮角逐产生：第一轮，入围总决赛的16支队伍每队均可分配到天河2号的128个节点，对指定应用赛题3D-EW进行优化;首轮成绩最好的2支队伍进入第二轮，两队均获得1024个节点的天河2号计算资源，进行应用性能PK及完成性能扩展挑战。最终上海交通大学凭借准确全面的应用优化和领先的计算性能从首轮角逐中出线，在第二轮王者PK中，上海交大队又凭借对天河2号超算系统全面深入的发挥将应用成功扩展到20万核并以42分钟成绩率先登顶，经由评审专家组审定荣获e Prize奖。
　　本次e Prize计算挑战奖的指定赛题3D-EW全名是“三维纵横波分离的弹性波方程模拟方法”，该赛题的软件来自中国石油东方地球物理公司(BGP)。中国石油勘探应用专家、BGP研究中心副主任罗国安表示，3D-EW主要采用交替网格的高精度有限差分算法，主要特点是频散小，计算精度高，但是计算量很大，具有很高的扩展潜力。这也正是BGP将该应用算法提供给大赛，希望汇集全球青年超算人才的智慧对软件进行优化的原因所在。他强调说，3D-EW将在未来用于石油勘探实际生产中，因此软件优化应结合实际，从解决现实问题的角度出发对软件进行针对性优化。
　　e Prize获奖队上海交通大学队员赵嘉明表示，他认为超算最终的目标是用来解决人类面临的现实问题，因此优化应该为实际应用而服务，需要在保证实际应用需要的基础上来提高代码的运行速度，“优化不仅要实现算例的扩展性，更重要的是保障算例的精度，保障优化过程中不会对原程序的可用性产生影响，所以在比赛前我们对石油勘探的物理模型进行了深入研究。”
　　在赛后举行的专访中，专家们认为此次e Prize奖表现出的高水平，充分表明此次大赛代表了中国大学生在超算应用优化的最高水平，也充分体现了天河2号全球最快超算的广泛应用前景和巨大潜力。

hswz的资料很及时，提前反驳了一些人可能发表的无端指责。

一流航发大国都用超算来跑ｃｆｄ计算　兔子自然早就有。

一流航发大国都用超算来跑ｃｆｄ计算　兔子自然早就有。

rfl9 发表于 2014-7-29 22:28
hswz的资料很及时，提前反驳了一些人可能发表的无端指责。
人家这样发帖本来就是想嘲讽土鳖　结果没中　呵呵

87330475 发表于 2014-7-29 22:48
人家这样发帖本来就是想嘲讽土鳖　结果没中　呵呵　

没错。昭然若揭。
而且退一万步说，就算没有这些应用，也不是超算的错。而是那些不会用超算的人的错。超算本身没有错，不应受到无端的攻击。

现代战争中雷达的作用越来越大，在雷达技术以及隐身技术中，雷达散射截面（RCS）的计算都是很重要的。雷达散射截面理论分析的实质就是计算出目标对给定入射波所产生的散射场，因此理论上所有求解电磁散射的理论和方法都可用于雷达散射截面的分析计算。随着现代电磁工程问题中计算目标的电尺寸不断增多，大部分数值方法，如矩量法、时域有限差分法、有限元方法等，需要很长的时间才能成功的仿真计算，但物理光学法（PO）仅需要较少的时间。然而，在计算电大尺寸目标的单站RCS时，由于计算过程中每个入射角度都需要进行遮挡判断和电流积分，需要的计算时间仍然比较长[1]。结合当今计算机软硬件的快速发展，利用计算机集群的大规模并行计算技术可以大幅度的减少计算的时间，提高计算的效率。本文采用并行PO方法在上海超级计算中心的“魔方”超级计算机[2]和国家超级计算济南中心的“神威蓝光”超级计算机[3]上对某飞机模型的单站RCS进行了仿真计算，并对该并行程序在并行规模高达1万或10万CPU核时的并行性能进行了测试。测试结果表明，该并行代码可以成功的运行于通用计算机平台和纯国产计算机平台上，并且可以获得比较好的并行效率。   
（2）济南超级计算中心的“神威蓝光”超级计算机中的6250个计算节点，每个计算节点包含16个SW 1600 1.0-1.1GHz CPU核，16GB内存，总共100000个CPU核。节点间采用Infiniband网络协议连接。
并行规模达100000 CPU核的性能测试本测试选取的计算平台为国家超级计算济南中心的“神威蓝光”超级计算机，计算模型为仍为图2所示的飞机模型（PEC），包含1441562个三角形面片。采用并行PO算法计算该模型在平面波入射情况下的单站RCS
由图5(a)可以看出，测试所得的加速比接近理想加速比。由图5(b)可以看出，在并行规模为10万CPU核时，并行效率仍接近95%。

hswz 发表于 2014-7-30 06:25
现代战争中雷达的作用越来越大，在雷达技术以及隐身技术中，雷达散射截面（RCS）的计算都是很重要的。雷达 ...
你是怎么找到这些的？

haocom 发表于 2014-7-30 10:20
你是怎么找到这些的？
人家有很多论文看，不象有的人只有个别杂志可看。