橡胶树基因组草图绘出

来源:百度文库 编辑:超级军网 时间:2024/03/29 04:12:25
日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7%的橡胶树基因组草图。

该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99%以上精度进行解读的“Illumina”方法,与7000个碱基长序列信息以85%精度解读的“PacBio”方法组合,解读出高于预想基因155倍的信息量,获得了1.55Gb的橡胶树基因组草图。然后,对获得的基因组草图进行了基因组注释,预测出约84000个遗传基因,包含全部93.7%以上的遗传基因信息。研究小组利用“CAGE法”对帕拉橡胶树的叶、茎和胶乳进行RNA检测,发现了全遗传基因的基因表达量和转录起始部位。结果显示,与叶、茎相比,胶乳的天然橡胶相关基因高出100倍以上。

胶乳是脂质和蛋白质组成的称为“橡胶粒子”的乳白色小分子悬浮液。研究发现,橡胶粒子的蛋白质基因在染色体组上,形成了在转录的相同方向排列的基因簇。在获得帕拉橡胶树遗传基因信息的基础上,研究小组对各种橡胶树育种系统重新测序,得到了品种间差异的详细信息。

天然橡胶广泛应用于汽车、飞机轮胎及医疗领域。由于天然橡胶具有耐磨损和抗冲击的特点,随着相关产业的发展,对天然橡胶的需求越来越大。现在世界上约90%以上的天然橡胶产自东南亚,帕拉橡胶树经品种改良后产量有所提高,但与优良树种的杂交改良需要丰富的经验和较长的时间。橡胶树基因草图的绘制成功,对开发生产更具优良特性的天然橡胶产品有重要意义。

相关研究成果发表在最新一期的《科学报告》上日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7%的橡胶树基因组草图。

该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99%以上精度进行解读的“Illumina”方法,与7000个碱基长序列信息以85%精度解读的“PacBio”方法组合,解读出高于预想基因155倍的信息量,获得了1.55Gb的橡胶树基因组草图。然后,对获得的基因组草图进行了基因组注释,预测出约84000个遗传基因,包含全部93.7%以上的遗传基因信息。研究小组利用“CAGE法”对帕拉橡胶树的叶、茎和胶乳进行RNA检测,发现了全遗传基因的基因表达量和转录起始部位。结果显示,与叶、茎相比,胶乳的天然橡胶相关基因高出100倍以上。

胶乳是脂质和蛋白质组成的称为“橡胶粒子”的乳白色小分子悬浮液。研究发现,橡胶粒子的蛋白质基因在染色体组上,形成了在转录的相同方向排列的基因簇。在获得帕拉橡胶树遗传基因信息的基础上,研究小组对各种橡胶树育种系统重新测序,得到了品种间差异的详细信息。

天然橡胶广泛应用于汽车、飞机轮胎及医疗领域。由于天然橡胶具有耐磨损和抗冲击的特点,随着相关产业的发展,对天然橡胶的需求越来越大。现在世界上约90%以上的天然橡胶产自东南亚,帕拉橡胶树经品种改良后产量有所提高,但与优良树种的杂交改良需要丰富的经验和较长的时间。橡胶树基因草图的绘制成功,对开发生产更具优良特性的天然橡胶产品有重要意义。

相关研究成果发表在最新一期的《科学报告》上
针对东南亚?
然而日本阳光不够,虽然其号称扶桑,培育出基因修改种的胶树说不准还是要去东南亚种
猎杀m1a2 发表于 2016-7-24 11:57
然而日本阳光不够,虽然其号称扶桑,培育出基因修改种的胶树说不准还是要去东南亚种
我国对经济作物的基因测序不知道完成的咋样
bjnr 发表于 2016-7-24 13:22
我国对经济作物的基因测序不知道完成的咋样
不大了解了。这个工作应该不难,就是看有经费和人手做没。
猎杀m1a2 发表于 2016-7-24 23:02
不大了解了。这个工作应该不难,就是看有经费和人手做没。
我开了一个简单的帖子 希望抛砖引玉

http://lt.cjdby.net/thread-2266114-1-1.html
从2010年至今,中国科学家陆续完成了牡蛎、大黄鱼、石斑鱼和半滑舌鳎的基因组测序并绘制出了全基因组序列图谱。此外,中国科学家还完成了淡水生物——鲤鱼和白鳍豚的全基因组测序。
2013年,我国科学家对白鳍豚、小须鲸、扬子鳄和南美白对虾等物种,完成了对其全基因组序列测定和分析工作。
  还有水稻  小麦 玉米 黄瓜  中国莲  陆地棉 白菜 甜橙 木薯  西瓜 椰枣(合作)  花生   辣椒

  合作的有  甘蓝型油菜  猕猴桃