暗科技:这家公司绝对会刷新你对基因检测的认识

来源:百度文库 编辑:超级军网 时间:2024/04/20 06:57:56
http://news.bioon.com/article/6673187.html

首页  体外诊断  暗科技:这家公司绝对会刷新你对基因检测的认识

暗科技:这家公司绝对会刷新你对基因检测的认识

来源:奇点网/周伦 2015-09-21 11:35


尝试过基因检测的健康人一定遇到过这样的情况。

检测报告里写到:“正常人群患XX癌症的概率是7%,你体内有XX突变,患癌症的概率是14%,同时有12%可能秃头。”

你心里一定有个疑问“我到底有没有患癌症?”

当我们谈论基因检测的时候,谈论的其实是DNA检测。我们忽略了RNA,它是基因检测中缺失的重要一环。但是,这一环也许会告诉你有没有患病。

今天给大家介绍一家也做基因检测的公司,它就是位于美国加州的Cofactor Genomics。之所以要介绍这家公司,是因为它捡起了基因检测中缺失的一个关键环节,它这一举动有可能开了基因检测领域的另一个先河–circRNA诊断。至于circRNA诊断是个什么东西,先按下不表,稍后你就会知道。

我们注意到这家公司的原因是,今年7月21日Cofactor Genomics对外宣布它获得了美国国立卫生研究院(NIH)150万美元的资助。当然150万美元对于一家生物技术公司来说,算不得什么。但是,我认为NIH资助的象征性意义,要远远大于这点金钱带来的好处。NIH资助的Cofactor Genomics的原因也很简单,越来越多的研究表明circRNA与包括冠状动脉疾病、帕金森病、精神疾病、癌症在内的疾病,有重大的关系。目前已经有研究表明circRNA可以作为生物标志物诊断某些疾病。

好了,先一起来看看circRNA诊断是什么,以及它的重要性。

其实介绍这家公司,让我挺头疼的。在咱们国家,大家都还没有明白DNA诊断,现在又冒出来一个circRNA诊断,真不知从何说起。

现在大家基本上都知道我们的生老病死是跟基因有关的。但是基因这个东西就是信息啊,并不直接参与生老病死。这个信息是沿着DNA→RNA→蛋白质,一级级传递,最终由蛋白质实现我们的生命功能的(比如,你的指甲,你的肌肉,都主要是蛋白质构成)。你要是还不理解,我就只能给你打比方了。

如果将一个公司的结构简化成三级,顶级的决策层、中间的管理层、下面的执行层。那么,公司的信息(或者决策)就会沿着这个层级流动,最终完成任务。现在我们通过DNA检测诊断疾病,就类似于通过分析公司上层的决策文件,了解任务能不能完成。如果上层决策文件出了问题,任务自然完不成。这就是DNA检测可以诊断疾病的原因。脑子活的朋友肯定立马会问,上层的决策文件没有问题,任务就一定会完成吗?当然不是,你还得看中间管理层不是?如果管理层这里出了问题,任务一样完不成。这就是DNA检测的缺陷,这正是RNA检测的优势。

我们知道在一个公司决策层可以只有一个人,但是管理层却是一大帮人。我们的细胞里面也是这样,DNA就是DNA,但是RNA却有一大帮。我们暂且不扯那么多,一是因为本文不涉及,而是怕把大家绕晕了。本文只讲mRNA(信使RNA,messenger RNA)、circRNA(环状RNA,circular RNA)和miRNA(小RNA,micro RNA)。

如果我们把mRNA比作是直接对蛋白质下达命令的管理层,那么miRNA和circRNA就是辅助下令的谋士。只不过miRNA是保守的文官,总是说“主公(mRNA),此事万万做不得呀!”;circRNA则是激进的武官,总会说“主公(mRNA),我等誓死拥护你的决定!”(但是,这里要申明一下,并不是所有的“主公”都有“谋士”。至于“主公”的“谋士”是怎么来的,为什么来,这个现在恐怕只有造物主知道。)



circRNA不在的时候,miRNA黏到对应的mRNA阻止蛋白质的生成



circRNA出现,拖走miRNA,mRNA合成蛋白质

mRNA没有人类那样的思考能力,它不知道到底该不该像女娲那样,制造没脑子的苦力蛋白质去干活。但是,如果保守的文官miRNA一直抱着他的大腿,那么mRNA就没工夫制造蛋白质,事情就做不了(专业术语叫“基因的表达被抑制了”);要是激进的武官circRNA过来把黏在mRNA身上的miRNA全部拖走,mRNA就会立马制造蛋白质,蛋白质就不分对错的开始干活(专业术语叫“基因的抑制被解除了”)。你现在明白了吗?

下面再举几个具体的例子,让我们看看circRNA和miRNA跟癌症的关系。

BCL2基因是一个癌基因,它与白血病、淋巴瘤和前列腺癌的发生密切相关。在正常的情况下,BCL2基因的mRNA表达被相应miRNA黏住了,所以基因不表达,癌症不发生;但是如果对应的circRNA出现了,那么miRNA就被活活拖走了,BCL2基因的mRNA就开始女娲造人般的制造蛋白质,这些蛋白质促进细胞的癌变,悲剧就发生了。

再来看看大名鼎鼎的抑癌基因P53,很多癌症的发生都与它的苦力蛋白质无法合成有关(当然,P53蛋白功能缺失的原因有很多,我们不一一介绍)。现在有研究已经发现了拖住P53基因mRNA的miRNA,这个时候如果对应的circRNA出现,P53基因mRNA就可以顺利制造蛋白质了,细胞癌变就会被阻止。

由上面两个例子不难看出,circRNA并无好坏之分,最终circRNA解除miRNA对基因表达的抑制,带来的后果,是跟对应基因的功能直接相关的。

现在你大概能够明白,circRNA检测可以诊断疾病的原因了。如果你懂了,却觉得打的比方、举得例子不够严谨,请你不要挑刺,我也不接受挑刺。你懂得就好。

但是,你心里也许还有另外一个疑问,“既然circRNA如此重要,你们早干啥去了,怎么到现在才开始检测这个?”

这个说来也挺委屈的,真不怪科学家们啊!实际上早在1991年就在人体内发现了circRNA,但是当时认为你这个家伙太稀少了。一直以来都被大家所忽视,直到2012年斯坦福大学的Julia Salzman发现circRNA在人体大量存在,这一改变教科书级的事实才大白于天下。紧接着2013年两篇重量级研究circRNA功能的文章发表在《Nature》上。研究circRNA的热潮开启了,越来越多的研究证明circRNA和很多疾病都有关系。

创立于2008年的Cofactor Genomics公司,是由参与人类基因组计划的科学家创办的,他们主要从事于RNA的测序,多年来已经积累了很多的测序经验。然后在目前研究circRNA的大背景下,Cofactor Genomics于今年率先转型,希望利用circRNA诊断疾病。当然,目前Cofactor Genomics的产品还处于研发阶段,不过第一阶段的研发工作已经顺利完成,NIH资助的是他们第二阶段的研发工作。预计明年会有产品上市。

当然,你不要以为我是在贬低DNA检测,实际上DNA检测和RNA检测一样重要,circRNA诊断是DNA诊断的一个重要的补充。

最后,祝Cofactor Genomics公司研发顺利,产品尽早上市,造福人类。(生物谷Bioon.com)

<< 去看24小时最新(0)

30分享:3

tulenzi
这是看到过的为数不多的用接地气的语言和思维将基因阐述清楚的文章。赞。。。
2天13小时前 顶

qian0305
不得不敬佩作者的表述能力,点赞………
2015-09-25 顶
登录


注册 立即登录

相关阅读

Nature子刊:将DNA测序精度提高1000倍
程钢:基因检测让你大声向乳腺癌说“不!”
Clinical Epigenetics:DNA甲基化检测或可帮助预测乳腺癌复发
程钢:基因检测让你大声向乳腺癌说“不!”
【盘点】DNA损伤修复与疾病发生关联性亮点研究一览
Nature commu:科学家用荧光分子揭开四链DNA神秘面纱
CMGH:新型肝癌DNA检测手段或改善患者生存率
Astrobiology:RNA & DNA 出现之前的核酸世界
Nature chemical biology:DNA损伤修复——老问题还有新进展http://news.bioon.com/article/6673187.html

首页  体外诊断  暗科技:这家公司绝对会刷新你对基因检测的认识

暗科技:这家公司绝对会刷新你对基因检测的认识

来源:奇点网/周伦 2015-09-21 11:35


尝试过基因检测的健康人一定遇到过这样的情况。

检测报告里写到:“正常人群患XX癌症的概率是7%,你体内有XX突变,患癌症的概率是14%,同时有12%可能秃头。”

你心里一定有个疑问“我到底有没有患癌症?”

当我们谈论基因检测的时候,谈论的其实是DNA检测。我们忽略了RNA,它是基因检测中缺失的重要一环。但是,这一环也许会告诉你有没有患病。

今天给大家介绍一家也做基因检测的公司,它就是位于美国加州的Cofactor Genomics。之所以要介绍这家公司,是因为它捡起了基因检测中缺失的一个关键环节,它这一举动有可能开了基因检测领域的另一个先河–circRNA诊断。至于circRNA诊断是个什么东西,先按下不表,稍后你就会知道。

我们注意到这家公司的原因是,今年7月21日Cofactor Genomics对外宣布它获得了美国国立卫生研究院(NIH)150万美元的资助。当然150万美元对于一家生物技术公司来说,算不得什么。但是,我认为NIH资助的象征性意义,要远远大于这点金钱带来的好处。NIH资助的Cofactor Genomics的原因也很简单,越来越多的研究表明circRNA与包括冠状动脉疾病、帕金森病、精神疾病、癌症在内的疾病,有重大的关系。目前已经有研究表明circRNA可以作为生物标志物诊断某些疾病。

好了,先一起来看看circRNA诊断是什么,以及它的重要性。

其实介绍这家公司,让我挺头疼的。在咱们国家,大家都还没有明白DNA诊断,现在又冒出来一个circRNA诊断,真不知从何说起。

现在大家基本上都知道我们的生老病死是跟基因有关的。但是基因这个东西就是信息啊,并不直接参与生老病死。这个信息是沿着DNA→RNA→蛋白质,一级级传递,最终由蛋白质实现我们的生命功能的(比如,你的指甲,你的肌肉,都主要是蛋白质构成)。你要是还不理解,我就只能给你打比方了。

如果将一个公司的结构简化成三级,顶级的决策层、中间的管理层、下面的执行层。那么,公司的信息(或者决策)就会沿着这个层级流动,最终完成任务。现在我们通过DNA检测诊断疾病,就类似于通过分析公司上层的决策文件,了解任务能不能完成。如果上层决策文件出了问题,任务自然完不成。这就是DNA检测可以诊断疾病的原因。脑子活的朋友肯定立马会问,上层的决策文件没有问题,任务就一定会完成吗?当然不是,你还得看中间管理层不是?如果管理层这里出了问题,任务一样完不成。这就是DNA检测的缺陷,这正是RNA检测的优势。

我们知道在一个公司决策层可以只有一个人,但是管理层却是一大帮人。我们的细胞里面也是这样,DNA就是DNA,但是RNA却有一大帮。我们暂且不扯那么多,一是因为本文不涉及,而是怕把大家绕晕了。本文只讲mRNA(信使RNA,messenger RNA)、circRNA(环状RNA,circular RNA)和miRNA(小RNA,micro RNA)。

如果我们把mRNA比作是直接对蛋白质下达命令的管理层,那么miRNA和circRNA就是辅助下令的谋士。只不过miRNA是保守的文官,总是说“主公(mRNA),此事万万做不得呀!”;circRNA则是激进的武官,总会说“主公(mRNA),我等誓死拥护你的决定!”(但是,这里要申明一下,并不是所有的“主公”都有“谋士”。至于“主公”的“谋士”是怎么来的,为什么来,这个现在恐怕只有造物主知道。)



circRNA不在的时候,miRNA黏到对应的mRNA阻止蛋白质的生成



circRNA出现,拖走miRNA,mRNA合成蛋白质

mRNA没有人类那样的思考能力,它不知道到底该不该像女娲那样,制造没脑子的苦力蛋白质去干活。但是,如果保守的文官miRNA一直抱着他的大腿,那么mRNA就没工夫制造蛋白质,事情就做不了(专业术语叫“基因的表达被抑制了”);要是激进的武官circRNA过来把黏在mRNA身上的miRNA全部拖走,mRNA就会立马制造蛋白质,蛋白质就不分对错的开始干活(专业术语叫“基因的抑制被解除了”)。你现在明白了吗?

下面再举几个具体的例子,让我们看看circRNA和miRNA跟癌症的关系。

BCL2基因是一个癌基因,它与白血病、淋巴瘤和前列腺癌的发生密切相关。在正常的情况下,BCL2基因的mRNA表达被相应miRNA黏住了,所以基因不表达,癌症不发生;但是如果对应的circRNA出现了,那么miRNA就被活活拖走了,BCL2基因的mRNA就开始女娲造人般的制造蛋白质,这些蛋白质促进细胞的癌变,悲剧就发生了。

再来看看大名鼎鼎的抑癌基因P53,很多癌症的发生都与它的苦力蛋白质无法合成有关(当然,P53蛋白功能缺失的原因有很多,我们不一一介绍)。现在有研究已经发现了拖住P53基因mRNA的miRNA,这个时候如果对应的circRNA出现,P53基因mRNA就可以顺利制造蛋白质了,细胞癌变就会被阻止。

由上面两个例子不难看出,circRNA并无好坏之分,最终circRNA解除miRNA对基因表达的抑制,带来的后果,是跟对应基因的功能直接相关的。

现在你大概能够明白,circRNA检测可以诊断疾病的原因了。如果你懂了,却觉得打的比方、举得例子不够严谨,请你不要挑刺,我也不接受挑刺。你懂得就好。

但是,你心里也许还有另外一个疑问,“既然circRNA如此重要,你们早干啥去了,怎么到现在才开始检测这个?”

这个说来也挺委屈的,真不怪科学家们啊!实际上早在1991年就在人体内发现了circRNA,但是当时认为你这个家伙太稀少了。一直以来都被大家所忽视,直到2012年斯坦福大学的Julia Salzman发现circRNA在人体大量存在,这一改变教科书级的事实才大白于天下。紧接着2013年两篇重量级研究circRNA功能的文章发表在《Nature》上。研究circRNA的热潮开启了,越来越多的研究证明circRNA和很多疾病都有关系。

创立于2008年的Cofactor Genomics公司,是由参与人类基因组计划的科学家创办的,他们主要从事于RNA的测序,多年来已经积累了很多的测序经验。然后在目前研究circRNA的大背景下,Cofactor Genomics于今年率先转型,希望利用circRNA诊断疾病。当然,目前Cofactor Genomics的产品还处于研发阶段,不过第一阶段的研发工作已经顺利完成,NIH资助的是他们第二阶段的研发工作。预计明年会有产品上市。

当然,你不要以为我是在贬低DNA检测,实际上DNA检测和RNA检测一样重要,circRNA诊断是DNA诊断的一个重要的补充。

最后,祝Cofactor Genomics公司研发顺利,产品尽早上市,造福人类。(生物谷Bioon.com)

<< 去看24小时最新(0)

30分享:3

tulenzi
这是看到过的为数不多的用接地气的语言和思维将基因阐述清楚的文章。赞。。。
2天13小时前 顶

qian0305
不得不敬佩作者的表述能力,点赞………
2015-09-25 顶
登录


注册 立即登录

相关阅读

Nature子刊:将DNA测序精度提高1000倍
程钢:基因检测让你大声向乳腺癌说“不!”
Clinical Epigenetics:DNA甲基化检测或可帮助预测乳腺癌复发
程钢:基因检测让你大声向乳腺癌说“不!”
【盘点】DNA损伤修复与疾病发生关联性亮点研究一览
Nature commu:科学家用荧光分子揭开四链DNA神秘面纱
CMGH:新型肝癌DNA检测手段或改善患者生存率
Astrobiology:RNA & DNA 出现之前的核酸世界
Nature chemical biology:DNA损伤修复——老问题还有新进展