超级军网『转帖』果壳：从基因角度分析H7N9病毒的来源和潜力—— ...
来源：百度文库 编辑：超级军网 时间：2024/04/24 03:29:28
首先有一篇Nature的新闻，4月2日的 http://www.nature.com/news/novel ... wo-in-china-1.12728
微博上@南都深度 翻译的，我看了一下，翻译的还不错。
如果你看不了这么长的内容，@yunzhengxw 总结了关键的几条信息：
看完了Nature的报道http://t.cn/zT2livi 摘要：
①鸟类感染H7N9病毒不会引起严重症状，故该病毒在鸟类中的传播难以监控；
②产生了适于感染哺乳动物细胞的关键变异（猪也是哺乳动物）；
③人类感染会导致严重症状；
④多地出现零星病例意味着病毒可能已在鸟类中扩散（因为不引起严重症状所以难以察觉）。
⑤初步数据显示，该病毒会影响肺部深处的细胞，这一般意味着引起严重的症状，不过也一般意味着不易人传人（不易影响鼻、喉，不易被咳出和喷出）；
⑥关于中国专家的响应速度，不用纠结了，Nature表扬了说很快，及时发表了研究数据，对全世界很有帮助。最重要的是自己能做的防护工作尽量做好。
最后说几句①病毒产生了适于感染哺乳动物的变异；②猪是哺乳动物；①+②→猪作为宿主的可能性不能排除；有专家说：“H7N9是禽流感病毒，只传染鸟，不传染猪，所以上海的猪肯定没问题”，专家有误，政府层面的轻敌是很危险的；但若有人现在说：“H7N9肯定是黄浦江死猪传播的”，他也没根据。不要太慌。
另外一个对于H7N9的病毒测序信息来自：http://epidemic.bio.ed.ac.uk/node/23
有一些微博账号也对上面链接中的信息进行了分析。
@来邦网：【H7N9的测序以及分析结果】在分离出H7N9病毒之后，对来自上海和安徽三例患者的病毒测序也已经完成，而初步的分析结果已经出炉，在下面的网站，你可以看到在H7N9的各种蛋白质以及核苷酸序列上所发生的突变。目前我并没有看到Q226L的突变点，有兴趣的朋友可以自己分析一下~
@丁香园
中国3例H7N9病毒测序已经完成，发现了一些特异性突变，注意：三株病毒在NP-Tree中并没有聚在一起
http://t.cn/zTywx2A
我们站内根据丁香园的微博有这么一个问题：
丁香园微博上提到的NP tree是一种什么技术，我查了半天没查到，那位同学可以给我讲解一下？
这个NP实际上是禽流感病毒内的一个基因（编码核衣壳蛋白 nucleoprotein，NP）的简写罢了。也就是说，NP-tree是基于这个蛋白的序列（应该是编码它的RNA序列）相似度构建的系统关系树。NP蛋白是和病毒RNA结合并包装的一个蛋白。
禽流感病毒含有10个基因，分散在8条ss-RNA上，分别是：
PB2 (polymerase basic 2 RNA聚合酶片段2)
PB1 (polymerase basic 1 RNA聚合酶片段1)
PA (polymerase acidic， 酸性聚合酶蛋白)
HA (hemagglutinin，血球凝集素，这个就是流感中那个H的来历)
NP (nucleoprotein，核衣壳蛋白)
NA (neuraminidase，神经氨酸酶，就是流感中那个N的来历)
M1 and M2 (matrix，基质蛋白1/2)
NS1 (non-structural 非结构蛋白)
NEP/NS2 (nuclear export of vRNPs 核输出蛋白)
丁香园的微博中的5个图，就是分别用PB2、PB1、PA、H7（实际上是HA）以及NP构建的关系树了。
然后今天微博上@Macgay 发了这么一条微博：http://weibo.com/1758748081/zqL8IzaZa
本实验室新鲜出炉的流感基因组种系发生分析结果：每个方框表示一种2012年以后在我国流感患者中检出的病毒HA基因片段，线条展示了它们之间的亲缘关系，每个节点代表一个共同祖先。结果表明：新发现的3株H7N9病毒已经可以成为一个新种系。另外我国东部的流感病毒变异速度显著高于西部地区的品种。
本帖会跟随更多关于此次H7N9的病毒的基因测序分析来更新。
我只是搬运工，具体问题请问@贝塔-鱼（病毒学博士研究生）等。
原帖：http://www.guokr.com/post/450585/
首先有一篇Nature的新闻，4月2日的 http://www.nature.com/news/novel ... wo-in-china-1.12728
微博上@南都深度 翻译的，我看了一下，翻译的还不错。
如果你看不了这么长的内容，@yunzhengxw 总结了关键的几条信息：
看完了Nature的报道http://t.cn/zT2livi 摘要：
①鸟类感染H7N9病毒不会引起严重症状，故该病毒在鸟类中的传播难以监控；
②产生了适于感染哺乳动物细胞的关键变异（猪也是哺乳动物）；
③人类感染会导致严重症状；
④多地出现零星病例意味着病毒可能已在鸟类中扩散（因为不引起严重症状所以难以察觉）。
⑤初步数据显示，该病毒会影响肺部深处的细胞，这一般意味着引起严重的症状，不过也一般意味着不易人传人（不易影响鼻、喉，不易被咳出和喷出）；
⑥关于中国专家的响应速度，不用纠结了，Nature表扬了说很快，及时发表了研究数据，对全世界很有帮助。最重要的是自己能做的防护工作尽量做好。
最后说几句①病毒产生了适于感染哺乳动物的变异；②猪是哺乳动物；①+②→猪作为宿主的可能性不能排除；有专家说：“H7N9是禽流感病毒，只传染鸟，不传染猪，所以上海的猪肯定没问题”，专家有误，政府层面的轻敌是很危险的；但若有人现在说：“H7N9肯定是黄浦江死猪传播的”，他也没根据。不要太慌。
另外一个对于H7N9的病毒测序信息来自：http://epidemic.bio.ed.ac.uk/node/23
有一些微博账号也对上面链接中的信息进行了分析。
@来邦网：【H7N9的测序以及分析结果】在分离出H7N9病毒之后，对来自上海和安徽三例患者的病毒测序也已经完成，而初步的分析结果已经出炉，在下面的网站，你可以看到在H7N9的各种蛋白质以及核苷酸序列上所发生的突变。目前我并没有看到Q226L的突变点，有兴趣的朋友可以自己分析一下~
@丁香园
中国3例H7N9病毒测序已经完成，发现了一些特异性突变，注意：三株病毒在NP-Tree中并没有聚在一起
http://t.cn/zTywx2A
我们站内根据丁香园的微博有这么一个问题：
丁香园微博上提到的NP tree是一种什么技术，我查了半天没查到，那位同学可以给我讲解一下？
这个NP实际上是禽流感病毒内的一个基因（编码核衣壳蛋白 nucleoprotein，NP）的简写罢了。也就是说，NP-tree是基于这个蛋白的序列（应该是编码它的RNA序列）相似度构建的系统关系树。NP蛋白是和病毒RNA结合并包装的一个蛋白。
禽流感病毒含有10个基因，分散在8条ss-RNA上，分别是：
PB2 (polymerase basic 2 RNA聚合酶片段2)
PB1 (polymerase basic 1 RNA聚合酶片段1)
PA (polymerase acidic， 酸性聚合酶蛋白)
HA (hemagglutinin，血球凝集素，这个就是流感中那个H的来历)
NP (nucleoprotein，核衣壳蛋白)
NA (neuraminidase，神经氨酸酶，就是流感中那个N的来历)
M1 and M2 (matrix，基质蛋白1/2)
NS1 (non-structural 非结构蛋白)
NEP/NS2 (nuclear export of vRNPs 核输出蛋白)
丁香园的微博中的5个图，就是分别用PB2、PB1、PA、H7（实际上是HA）以及NP构建的关系树了。
然后今天微博上@Macgay 发了这么一条微博：http://weibo.com/1758748081/zqL8IzaZa
本实验室新鲜出炉的流感基因组种系发生分析结果：每个方框表示一种2012年以后在我国流感患者中检出的病毒HA基因片段，线条展示了它们之间的亲缘关系，每个节点代表一个共同祖先。结果表明：新发现的3株H7N9病毒已经可以成为一个新种系。另外我国东部的流感病毒变异速度显著高于西部地区的品种。
本帖会跟随更多关于此次H7N9的病毒的基因测序分析来更新。
我只是搬运工，具体问题请问@贝塔-鱼（病毒学博士研究生）等。
原帖：http://www.guokr.com/post/450585/
黄浦江死猪到底怎么回事？有人能说说科普一下吗，我只知道这件事至于来龙去脉最新情况一概不知啊。